至於在日本動畫發展的歷史上，也有不少黑歷史的存在，今天我們就舉幾個事件當例子。
01
《城市獵人》出現犯罪者照片
《城市獵人》這部作品是不少人的回憶，但是在《城市獵人III》的播放中卻出現了問題。
動畫第11話《聖誕節的婚紗》中竟然出現了日本犯罪者麻原彰晃的照片，而至今為止動畫被放入此照片的原因依舊未明。
02
《精靈寶可夢》送醫事件
在《精靈寶可夢》的《電腦戰士多邊獸(舊譯3D龍)》這一集裡，動畫組為了表現電腦世界的效果，將爆炸場景通過紅藍閃現的方式呈現出來。
然而這種閃現畫面，卻引起了眾多觀看該動畫的兒童出現光敏感癲癇症。
當時的製作人員都為成年人，視神經已經發育成熟，所以並沒有發現問題，也才發生了此次事件。
03
《心連·情結》官方整人事件
《心連·情結》的官方曾經策劃過一場整人企劃，邀請了市來光弘等聲優，告訴他們動畫還需要一名角色，並讓他們進行試音。
但事實上動畫組並不打算增加角色，而被邀請的聲優也完全不知情，他們甚至還騙聲優們說了不少很羞恥的台詞，之後試音的片段還被動畫官方拿來惡搞。
原本此事情也就不了了之，但奈何這部動畫的音樂人菊地創惹怒粉絲，其後日本網友挖出了官方整人事件的全過程，不但引發眾怒，動畫也跟著被牽連了。
04
《神薙》O女事件
《神薙》這部動畫第一季當時以超高的人氣完結，就在粉絲們翹首以盼第二季的時候，有人認為連載中的漫畫隱晦地告訴大家，女主角已經不是O女了。
以此為由，部分過度腦補的讀者終於爆發，先是將和《神薙》有關的東西毀的毀燒的燒，甚至還有人向作者寄刀片並揚言要解決掉作者。
據傳當時此事件讓作品走上了休刊之路，不過根據wiki資料紀載，其實是武梨えり老師突然患上重病送醫治療，只是兩者時間點太過剛好而已。
05
《School Days》第11.5話
其實第11.5話是因為當時日本發生了一則震驚社會的事件，一名十多歲的少女在家用斧頭將自己的父親殘忍殺害。
而動畫的最後一話也有類似的情景，於是官方臨時為了避開風頭，將最終話替換成了風景片，這一話也被觀眾們調侃為第11.5話。
06
《涼宮春日的憂鬱》漫無止境的8月
2009版《涼宮春日的憂鬱》中的一個章節，總共8集，每集的劇情都一樣，但是每個場景的分鏡頭卻完全不同。
整整兩個月，而且播放的時間正好就在7、8月份，也因此次事件讓不少動漫迷由粉轉黑。
07
《火星異種》黑洞事件
由於畫面過於殘酷，官方選擇打碼，但這樣遮掩反而更讓人在意。之後這便被日本網友當成梗，在推上玩壞了……
08
《阿松》惡搞
《阿松》第一話內容惡搞了多部知名作品，最終無法收錄在發售的光碟中不說，各大影音網站也必須下架。
【傳奇人物】英國版花木蘭？混入軍隊半個世紀！死後才發現她是女的！｜下水道先生
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